孕酮的效果主要是在月经周期后期使子宫粘膜内腺体成长，子宫充血，内膜增厚，为受精卵植入作好预备。女人排卵时，在黄体排泄的孕激素效果下，子宫内膜由增殖期转化为排泄期，使子宫内膜对胚胎着床具有容受性。蜕膜细胞由内膜间质细胞转化而来，含有糖元颗粒，供应胚胎养分。
孕激素能诱导子宫内膜间质蜕膜化改动，并以自排泄或旁排泄的方式调理各种着床相关因子的表达。所以，孕酮是保持蜕膜反响所必需的。
怀孕期
受精卵植入后则使之发生胎盘，孕酮使之削减妊娠子宫的兴奋性，按捺其活动，使胎儿安全成长。孕酮能够改动子宫细胞膜对离子的通透性，使膜处于超级化状况，因此降低了子宫肌兴奋性和传导性，并降低了子宫肌对各种影响(包含缩宫素)的敏感性，然后避免子宫将胚胎排出，起到保胎效果。
在这段时期内的孕酮是有免疫维护功用，按捺免疫反响的效果。有研讨将某种肿瘤细胞植入动物子宫内，只要在注射了孕酮的动物，细胞才不被排挤，并向子宫壁植入，阐明孕酮可按捺免疫反响。
生育后
在与雌激素一起效果下，促进乳房充沛发育，为产乳作预备。雌激素促进乳腺管和管周本质安排的成长，孕酮促进乳房小叶和腺泡结构的发育。
但若没有雌激素的效果，孕酮对乳房的效果则微乎其微。